“十一五”期间，学院注重党团组织的自身建设，把学生的思想道德教育放在首位。多年来，学院团学办不仅完成了学生各项日常管理工作，而且学生思想政治教育工作等许多方面取得了骄人的成绩。2001年我院创立并长期坚持开展的“杏林飘香入社区”志愿者活动，深受广大群众的欢迎和好评；2006年成立的“蒲公英”志愿者团队，在全国“关爱女孩”行动和“青春期生殖健康同伴教育”工作中取得了突出成绩，连年获得“首都暑期社会实践优秀团队”称号，并反复得到多家主流媒体的宣传报道。此外，我院还孕育了一批诸如“英语角”、“党旗在我心中”等有学院特色的项目活动，有效地促进了我院学生医德医风教育、志愿奉献精神和实践动手能力的提高。学院团总支在党总支的指导下，规范了组织培养和发展程序，认真开展推优入党工作，“十一五”期间共发展党员249名。同时，我院还注重学生科研能力的培养，五年来我院学生成功申报大学生科研活动34项，其中教育部资助23项，北京市资助5项，校级资助6项。“十一五”末，我院先后有5个班级获得“北京市先进班集体”称号，3个团支部被评为“北京市优秀团支部”。
此外，我院高度重视毕业生就业工作。在学生人数不断增加的情况下，经过全院师生的共同努力，针灸推拿学院毕业生一次就业率逐年递增，到“十一五”建设后期已达95%左右，较“十五”期间有了较大幅度提升。